| 1 | 三内丸山遺跡 | 青森県青森市三内 |  |
0177-34-9924 | 青森県教育庁文化課三内丸山遺跡対策室 |
| 2 | 北斗遺跡 | 北海道釧路市北斗 | |||
| 3 | 朱円環状土籬(ﾘ) | 北海道斜里郡斜里町朱円 | ｽﾄｰﾝ･ｻｰｸﾙの変形 | ||
| 4 | 忍路ｵｼｮﾛ環状列石 | 北海道小樽市忍路 |  |
約３，５００年前、縄文時代後期の遺跡。 ストーン・サークルの用途は墓地で、死者を弔う儀式も行われていたと考えられている |
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| 5 | 常呂遺跡 | 北海道常呂郡常呂町（合併後：北見市） | 0152-54-3393 | ところ遺跡の館 | |
| 6 | 音江環状列石 | 北海道深川市音江町向陽 |  |
かつては祭址かチャシ（とりで）かと想像されていたが、その後の調査で先住民の墓であると結論された。 深さ１ｍの穴を掘って埋葬した後、土を埋め戻しその上に付近に産する安山岩を打ち砕いて積み、その周囲になるべく大きい安山岩を立てめぐらしたもので、積み石の数の多いものは５００個に及ぶものもある |
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| 7 | モヨロ貝塚 | 北海道網走市北２条東２丁目 | 0152-43-2608 | モヨロ貝塚館 | |
| 8 | フゴッペ洞窟 | 北海道余市郡余市町栄町 | 0135-22-6170 | フゴッペ洞窟 | |
| 9 | 西崎山ストーン・サークル | 北海道余市郡余市町栄町 | |||
| 10 | 亀ケ岡遺跡 | 青森県西津軽郡木造町（合併後：つがる市） |  |
0173-42-6490 | 木造町縄文住居展示資料館 |
| 11 | 続石 | 岩手県遠野市綾織町上綾織 | 巨石文化の墳墓 | ||
| 12 | 堀野遺跡 | 岩手県二戸市福岡 | R4沿い、環状列石と竪穴住居跡 | ||
| 13 | 樺山（ｶﾊﾞﾔﾏ）遺跡 | 岩手県北上市稲瀬町 | |||
| 14 | 大湯環状列石 | 秋田県鹿角市十和田大湯 | 別ページ | 0186-30-1111 | 鹿角市教育委員会、鹿角市出土文化財管理ｾﾝﾀｰ0186-37-3822 |
| 15 | 伊勢堂岱遺跡 | 秋田県北秋田郡高巣町（合併後：北秋田市） | 0186-62-1111 | 高巣町教育委員会 | |
| 16 | 雷神山古墳 | 宮城県名取市植松 | 022-384-2111 | 名取市教育委員会 | |
| 17 | 白山住居跡 | 福島県伊達郡飯野町（合併後：福島市）飯野 | |||
| 18 | 大塚山古墳 | 福島県会津若松市一箕（ｲｯｷ）町 | 全長114m、2〜3段の多段築成 | ||
| 19 | 根古谷台遺跡 | 栃木県宇都宮市上欠町 | |||
| 20 | 長岡百穴古墳 | 栃木県宇都宮市長岡町 | |||
| 21 | 星野遺跡公園・憩の森 | 栃木県栃木市星野町 | |||
| 22 | 岩宿遺跡 | 群馬県新田郡笠懸町（合併後：みどり市）阿佐美 | 笠懸野岩宿文化資料館0277-76-1701、月曜休 | ||
| 23 | 阿佐美縄文式文化住居跡 | 群馬県新田郡笠懸町（合併後：みどり市）阿佐美 | |||
| 24 | 十五郎横穴群 | 茨城県ひたちなか市中根 | |||
| 25 | 上高津貝塚 | 茨城県土浦市上高津 | |||
| 26 | 埼玉古墳群 | 埼玉県行田市大字埼玉 | 埼玉県立さきたま資料館0485-59-1111 | ||
| 27 | 地蔵塚古墳 | 埼玉県行田市藤原町 | |||
| 28 | 八幡山古墳石室 | 埼玉県行田市藤原町 | |||
| 29 | 吉見百穴 | 埼玉県比企郡吉見町北吉見 | |||
| 30 | 加曾利貝塚 | 千葉県千葉市若葉区桜木町 | 千葉市立加曾利博物館043-231-0129、月曜休 | ||
| 31 | 大森貝塚（遺跡庭園） | 東京都品川区大井 | 03-3777-4060 | 品川区立品川歴史館 | |
| 32 | 中里貝塚 | 東京都北区上中里 | 03-3916-1133 | 北区飛鳥山博物館 | |
| 33 | 釈迦堂遺跡 | 山梨県東八代郡一宮町・東山梨郡勝沼町 （合併後：笛吹市） |
釈迦堂遺跡博物館0553-47-3333、火曜休 | ||
| 34 | 尖石遺跡 | 長野県茅野市豊平 | 茅野市尖石考古館0266-76-2270、月曜休 | ||
| 35 | 森将軍塚古墳 | 長野県更埴市（合併後：千曲市）大字森字大穴山 | 026-274-3400 | 森将軍塚古墳館 | |
| 36 | 大深山遺跡 ｵｵﾐﾔﾏ | 長野県南佐久郡川上村大深山 | 0267-97-3059 | 月曜休 | |
| 37 | 登呂遺跡 | 静岡県静岡市登呂 | 静岡市立登呂博物館054-285-0476、月曜・祝日の翌日休 | ||
| 38 | 柏谷横穴群 | 静岡県田方郡函南町柏谷 | |||
| 39 | 蜆塚遺跡 | 静岡県浜松市蜆塚 | 浜松市立博物館0534-56-2208 | ||
| 40 | 愛知県清洲貝殻山貝塚資料館 | 愛知県西春日井郡清洲町（合併後：清須市）朝日 | 052-409-1467 | 月曜休 | |
| 41 | 鞍船遺跡 | 愛知県北設楽郡津具村（合併後：設楽町）鞍船 | |||
| 42 | 粥見井尻遺跡 | 三重県飯南郡飯南町（合併後：松阪市） | 0598-32-2300 | 飯南町教育委員会 | |
| 43 | 長者ケ原遺跡 | 新潟県糸魚川市一の宮 |  |
0255-52-1511 | 糸魚川市教育委員会、天津神社の南側 |
| 44 | 桜町遺跡 | 富山県小矢部市 |  |
0766-67-8122 | 小矢部ふるさと歴史館 |
| 45 | 高瀬遺跡 | 富山県東砺波郡井波町（合併後：南砺市）高瀬 | 井波歴史民族資料館0763-82-5050、月曜休 | ||
| 46 | 大境洞窟住居跡 | 富山県氷見市大境 | |||
| 47 | チカモリ遺跡 | 石川県金沢市新保本5-47 | 0762-69-2451 | 金沢市埋蔵文化財ｾﾝﾀｰ | |
| 48 | 雨の宮古墳群 | 石川県鹿島郡鹿西町（合併後：中能登町）能登部上 | |||
| 49 | 真脇遺跡 | 石川県鳳至郡能都町（合併後：能登町） |  |
0768-62-2100 | 能都町教育委員会 |
| 50 | 瓢箪山古墳 | 滋賀県蒲生郡安土町桑実寺 | |||
| 51 | 大中の湖 南遺跡 | 滋賀県蒲生郡安土町大中 |  |
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| 52 | 皇子山古墳 | 滋賀県大津市錦織 | |||
| 53 | 春日山古墳群 | 滋賀県大津市真野谷口町 | |||
| 54 | 大岩山古墳群 | 滋賀県野洲郡野洲町（合併後：野洲市）小篠原・冨波・辻町 | ７古墳 甲山・円山・宮山２号・大塚山・亀塚・古冨波山・富波 | ||
| 55 | 百舌鳥古墳群 | 大阪府堺市大仙町 | 0722-45-6201 | 堺市博物館、仁徳天皇陵を含む | |
| 56 | 池上曽根遺跡 | 大阪府和泉市池上町 | 0725-41-1551 | 和泉市教育委員会、近くに府立弥生文化博物館0725-46-2162 | |
| 57 | 唐古・鍵遺跡 | 奈良県磯城郡田原本町唐古 | 07443-2-2901 | 田原本町教育委員会 | |
| 58 | キトラ古墳 | 奈良県高市郡明日香村 | 0744-54-5600 | 明日香村教育委員会事務局文化財課 | |
| 59 | 伝飛鳥板蓋（ｲﾀﾌﾞｷ）宮跡 | 奈良県高市郡明日香村岡 | |||
| 60 | 酒船石 | 奈良県高市郡明日香村岡 | |||
| 61 | 石舞台 | 奈良県高市郡明日香村島庄 | |||
| 62 | 飛鳥水落遺跡 | 奈良県高市郡明日香村飛鳥 | |||
| 63 | 高松塚古墳 | 奈良県高市郡明日香村平田 | 0744-54-3340 | 高松塚壁画館、月曜休 | |
| 64 | 纏（ﾏﾄｲ）向遺跡 | 奈良県桜井市 | 0744-42-6005 | 桜井市立埋蔵文化財ｾﾝﾀｰ | |
| 65 | 藤ノ木古墳 | 奈良県生駒郡斑鳩町法隆寺西２ | 0744-24-1185 | 奈良県立考古学研究所付属博物館 | |
| 66 | 黒塚古墳 | 奈良県天理市 | 0744-24-1101 | 奈良県立橿原考古学研究所 | |
| 67 | 妻木晩田遺跡 | 鳥取県西伯郡大山町・淀江町 | |||
| 68 | 加茂岩倉遺跡 | 島根県大原郡加茂町（合併後：雲南市）岩倉 | 0852-36-8608 | 島根県埋蔵文化財調査ｾﾝﾀｰ | |
| 69 | 荒神谷遺跡 | 島根県簸川郡斐川町神庭 ｶﾝﾊﾞ | 0853-72-9044 | 出雲の原郷館、荒神谷史跡公園0853-72-7695 | |
| 70 | 造山古墳 | 岡山県岡山市新庄下 | 086-225-4211 | 岡山市教育委員会 | |
| 71 | 四ツ塚古墳群 | 岡山県真庭郡八束村（合併後：真庭市）上長田 | |||
| 72 | 楯築遺跡・楯築神社跡 | 岡山県倉敷市矢部 | |||
| 73 | 作山古墳 | 岡山県総社市三須 | |||
| 74 | 三因（ﾐﾖﾘ）の古墳群 | 岡山県都窪郡清音村（合併後：総社市）三因 | |||
| 75 | 土井ケ浜遺跡 | 山口県豊浦郡豊北町（合併後：下関市）神田 | 0837-88-1841 | 土井ケ浜遺跡人類学ﾐｭｰｼﾞｱﾑ | |
| 76 | 有岡古墳群 | 香川県善通寺市善通寺町 | |||
| 77 | 明見彦山古墳群 | 高知県南国市明見 | |||
| 78 | 王塚古墳 | 福岡県嘉穂郡桂川町寿命 | 0948-65-2900 | 王塚装飾古墳館、月曜休 | |
| 79 | 平塚川添遺跡 | 福岡県甘木市（合併後：朝倉市）大字平塚 | 0946-22-0001 | 甘木市教育委員会文化課 | |
| 80 | 綾塚古墳 | 福岡県京都郡勝山町（合併後：みやこ町）黒田 | |||
| 81 | 沖ノ島祭祀遺跡 | 福岡県宗像郡玄海町（合併後：宗像市）沖島 | 0940-62-1311 | 宗像大社神宝館、神湊波止場から大島村営ﾌｪﾘｰ | |
| 82 | 須玖岡本遺跡群 | 福岡県春日市岡本 | 092-501-1144 | 春日市奴国の丘歴史資料館 | |
| 83 | 平原遺跡 | 福岡県前原市井原 | 092-323-1111 | 前原市教育委員会 | |
| 84 | 志登支石墓群 | 福岡県前原市志登 | 092-323-1111 | 前原市教育委員会、発掘品は伊都歴史資料館092-322-7083 | |
| 85 | 八女古墳群 | 福岡県八女市吉田・八女郡広川町 | 0943-22-6111 | 岩戸山歴史資料館、岩戸山古墳が中心 | |
| 86 | 元寇防塁跡 | 福岡県福岡市博多区東公園 | 092-651-1259 | 元寇資料館 | |
| 87 | 板付遺跡 | 福岡県福岡市博多区板付 | 092-571-2921 | 福岡市埋蔵文化財ｾﾝﾀｰ、月曜休 | |
| 88 | 吉野ヶ里遺跡 | 佐賀県神碕郡神碕町・三田川町・東背振町 （合併後：神崎町は神崎市、他は吉野ヶ里町） |
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0952-25-7233 | 佐賀県教育庁文化財課吉野ヶ里遺跡班、吉野ヶ里歴史公園0952-53-5910 |
| 89 | 菜畑遺跡 | 佐賀県唐津市菜畑 | 0955-73-3673 | 末盧館 | |
| 90 | 原の辻遺跡 | 長崎県壱岐郡芦辺町・石田町（合併後：壱岐市） | 09204-5-4080 | 原の辻展示館 | |
| 91 | 西都原古墳群 | 宮崎県西都市三宅 |  |
0983-43-1354 | 宮崎県総合博物館西都原資料館 |
| 92 | 茶臼原古墳群 | 宮崎県西都市茶臼原 ﾁｬｳｽﾊﾞﾙ |  |
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| 93 | 石貫ﾅｷﾞﾉ横穴群 | 熊本県玉名市石貫 | |||
| 94 | チブサン古墳 | 熊本県山鹿市城 | 0968-43-1145 | 山鹿市立博物館、荒神谷史跡公園0853-72-7695 | |
| 95 | 鍋田横穴 | 熊本県山鹿市鍋田 | |||
| 96 | 大村横穴群 | 熊本県人吉市城本町 | |||
| 97 | 上野原遺跡 | 鹿児島県国分市（合併後：霧島市）川内 |  |
0995-4-1977 | 上野原遺跡資料館 |
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